A Pró-Reitoria de Extensão, Pesquisa, Pós-Graduação e Inovação (PROEPPI) tem por competência a organização, o planejamento, a supervisão e a coordenação das políticas de pesquisa, de extensão e de inovação nos níveis básico, técnico e tecnológico e políticas de pós-graduação do Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia Catarinense, estimulando o desenvolvimento de soluções técnicas e tecnológicas, estendendo seus benefícios à comunidade.